JBR Genome Browser Archived

Description

Группа BioLabs разрабатывает новые алгоритмы и методы анализа биологических данных, а также работает в тесном сотрудничестве с биологами над различными экспериментами по изучению старения. Для анализа результатов эксперимента необходимо не только получать и обрабатывать данные, но и эффективно их визуализировать.

JBR Genome Browser - это новый инструмент для визуализации и анализа геномных данных, разрабатываемый в группе и используемый в реальных исследованиях.

В рамках данной стажировки Вы познакомитесь с основными подходами для визуализации геномных данных, узнаете про устройство современных геномных браузеров и поучаствуете в разработке новых функций JBR Genome Browser, таких как:

  • Создание Модуля для создания произвольной геномной разметки
  • Поддержка файлов визуализации популярного инструмента Cell Ranger
  • Реализация асинхронного веб интерфейса браузера
  • и другие

Бонус: Приложение разрабатывается на языке программирования Kotlin, участие в проекте - замечательная возможность приобрести опыт разработки на перспективном языке программирования.

Вопросы можно задавать по почте: os@jetbrains.com

Requirements

  • Опыт программирования на Java или Kotlin
  • Понимание основных алгоритмов и структур данных
  • Интерес к визуализации данных
  • Бонусом будет опыт разработки клиент-серверных приложений

Mentor

Oleg Shpynov

Contact details

internship@jetbrains.com

Location

Remote

Product/Team

JetBrains Research

Technologies

Kotlin